Unit Uta dikirim ke sebuah pabrik terbengkalai untuk menyelidiki gelombang gravitasi misterius. Mereka menemukan kaiju kecil yang ketakutan dan terluka dengan kemampuan untuk melakukan perjalanan waktu! Ketika kaiju tersebut membawa Sorato dan Kosei ke masa depan, mereka melihat apa yang telah terjadi pada umat manusia akibat pengembangan teknologi untuk tujuan memusnahkan kaiju...