秘密の池 ミズゴロウがいっぱい

サトシ一行は修行の場と新しいポケモンとの出会いを求めて森の中を進むと滝に突き当たり、滝の上を登った先でミズゴロウの赤ちゃんたちが生息する秘密の池に辿り着く。そこにいるミズゴロウたちはヌマじいことヌマタが新人トレーナー用に育てていたポケモンだった。しかし、小さなミズゴロウたちの中に大きく育ったミズゴロウが1匹だけおり、話を聞けばいつしか紛れ込んできた野生のミズゴロウで、既に育ちすぎて貰い手がないという。間もなくしてミズゴロウを狙って現れたロケット団によって堰（せき）が壊されてミズゴロウたちが流されてしまう！ミズゴロウの赤ちゃんを助けようと川へ飛び出した大きなミズゴロウも流されそうになるがタケシに助けられる。それがきっかけでタケシと大きなミズゴロウは仲良くなり、ヌマじいの頼みもあってミズゴロウがタケシの新たな仲間に加わった。