Para anggota SKIP bekerja sama dengan Satoru Yamagami, dari Unit Analisis Kaiju Markas SKIP. Rin sebenarnya sudah mengenal Yamagami bahkan sebelum bergabung dengan SKIP dan merasa nostalgia atas pertemuan kembali mereka. Namun, Yamagami dicurigai memperdagangkan sel kaiju di pasar gelap dan Rin memutuskan untuk ikut serta dalam penyelidikan, tetapi...