オーキド博士とオダマキ博士 秘密基地の戦い

サトシ一行はオーキド博士を迎えに港へ向かっていたオダマキ博士と再会する。サトシとタケシはオダマキ博士に同行し、ハルカとマサトは研究所で待つ事にしたが、オーキド博士はサトシ達と行き違い、研究所に到着してしまう。オーキド博士にホウエンでは珍しいカントー地方の新人トレーナー用ポケモン（フシギダネ、ヒトカゲ、ゼニガメ）を見せてもらったマサトは大興奮。またそれを隠れて見ていたロケット団も現れて、ポケモン達が奪われてしまった！ロケット団の後を追ったオーキド博士とハルカ、マサトはロケット団の基地に入り、まんまと罠にはめられてしまうも、3人の協力で突破してポケモン達を無事救出。後から駆け付けたサトシ達とも合流して、ポケモン達の総攻撃でロケット団を撃退した。その後サトシ達は次のジムがあるヒワマキシティを目指して旅立つのだった。