帰ってきた マサラタウン

オレンジ諸島から故郷マサラタウンへ帰ってきたサトシ一行。実家にはダイダイ島のウチキド博士の研究所に残ったタケシがいた。事情を聞こうとしても聞かないでくれの一点張り。サトシ達はお使いのGSボールを渡しにオーキド研究所を訪れ、ケンジはついに憧れのオーキド博士と出会う。サトシ達が研究所内を見学しているとロケット団の三人組がボス（サカキ）への手土産として研究所にいるポケモン達を研究所諸共テントで包囲する。研究所にあるモンスターボールやGSボールがロケット団に奪われそうになったがマサラタウンに帰ってきたシゲルがニドクインでロケット団を撃退しモンスターボールを取り戻す。シゲルはポケモンリーグ・セキエイ大会で敗退して以来今までのようなお気楽な生活を止め、ポケモン達や自らを鍛えるため修行に出ていたのだ。サトシはそんなシゲルに対抗心を燃やしポケモン勝負を挑む。果たして勝つのはどちらなのか！？