Inazuma Eleven Go Chrono Stone 01

Inazuma Eleven Go: Chrono Stone bersetting setelah Turnamen Sepak Bola Jalan Suci. Pahlawan saat ini, Tenma Matsukaze, berkeliling Jepang untuk mengajar sepak bola kepada anak-anak. Dia kembali ke SMP Raimon setelah menyelesaikan misinya, tapi yang mengejutkannya, SMP Raimon itu bukan lagi SMP Raimon yang dia ingat. Klub sepak bola tidak ada, dan anggota tim juara di Turnamen Sepak Bola Jalan Suci tidak ingat pernah mengambil bagian dalam turnamen tersebut. Mereka tidak ingat Tenma atau permainan sepak bola yang mereka sukai. Saat Tenma bingung dengan perubahan ini, Alpha, pemimpin Agen Rute dan kapten tim Protokol Omega, tiba-tiba muncul di hadapannya. Alpha menyatakan bahwa dia dan timnya bertanggung jawab untuk menghapuskan hasrat terhadap sepak bola di Raimon bersama dengan kenangan para anggota klub sepak bola: dan Tenma sendiri adalah yang berikutnya. Saat itulah seorang anak laki-laki aneh bernama Fei Rune muncul tepat pada waktunya untuk menyelamatkannya. Siapakah Fei, dan mengapa Alpha ingin menghilangkan sepak bola selamanya? Tenma tahu bahwa dia perlu melakukan segala daya untuk bisa menang. Ini adalah pertarungan yang bisa menentukan nasib sepak bola selamanya.