Фанагория была второй столицей Боспорского царства, пережила восстание против Митридата Шестого Евпатора, гибель от рук гуннов и разгром при Юстиниане Первом, а после хазарского возрождения исчезла в схватке трёх средневековых держав.
Сегодня половина города скрыта под землёй и водой Таманского полуострова, а археологи продолжают находить всё новые свидетельства пятнадцати веков его истории, от сожжённого корабля флота Митридата до персидской стелы царя Дария Первого.