Pokemon XY Mega Evolution Special I - Sub Ika -

Sebelumnya asisten Profesor Platane dari Kota Lumiose, Alain dan Lizardon-nya memulai perjalanan untuk menjadi lebih kuat dengan menguasai kekuatan mega evolusi. Menyelidiki misteri fenomena ini, atas perintah Fleur-de-lis yang penuh teka-teki, Alain dan Lizardon melakukan perjalanan melintasi Kalos dan Hoenn untuk mencari pelatih yang mampu menggunakan mega evolusi untuk meningkatkan kemampuan mereka, serta membantu Fleur-de-lis dalam penelitiannya. Di sepanjang perjalanan, mereka bertemu dengan seorang gadis muda bernama Manon yang, bersama Harimaron-nya, memutuskan untuk menemani Alain, yang dengan enggan disetujuinya. Pokemon XY: Mega Evolution mengikuti perjalanan Alain dan Lizardon untuk menjadi pengguna mega evolusi terkuat, sambil juga melawan monster legendaris untuk melindungi ambisi Fleur-de-lis serta keselamatan orang-orang yang paling penting baginya.