Cerita berfokus pada sekelompok anak kelas enam SD yang menghadapi perubahan dalam hubungan persahabatan mereka saat musim panas tiba. Tokoh utamanya, Kosuke Kumagaya dan Natsume Tonai, telah bersahabat sejak kecil seperti saudara, tetapi hubungan mereka mulai renggang dan penuh kecanggungan setelah Kosuke kehilangan kakeknya—yang juga sangat dekat dengan Natsume.
Suatu hari, saat liburan musim panas, Kosuke, Natsume, dan teman-temannya (termasuk Yuzuru, Taishi, Reina, dan Juri) bermain di kompleks apartemen tua Kamonomiya yang akan dibongkar. Kompleks ini penuh dengan kenangan masa kecil mereka, tetapi tiba-tiba mereka terjebak dalam fenomena misterius yang membuat seluruh bangunan terbawa ke tengah samudra luas yang tak diketahui.
Terombang-ambing di lautan dengan gedung sebagai “kapal” mereka, kelompok anak ini harus bersatu menghadapi tantangan fisik dan emosional di tengah gelombang besar, badai, serta kekosongan masa depan yang tak pasti. Selama perjalanan, hubungan Kosuke dan Natsume diuji, persahabatan diuji, dan masing-masing dari mereka mulai menghadapi kenangan, penyesalan, serta perasaan yang belum terselesaikan.