ゲンとルカリオ!

次のポケモンコンテストが開かれるアケビタウンへ向けて出発しようとしていたサトシ達にジュンから連絡が入った。ジュンのエンペルトやこうてつじまのポケモン達が突如おかしくなってしまったのだという。サトシ達はこうてつじまへ向かい、原因を突き止めようとしたが、大暴れする島のポケモン達に襲われてしまう。その危機を救ってくれたのは鋼ポケモン使いのゲンとパートナーのルカリオだった。彼らの調査の結果この島に発生した特殊な低周波が鋼ポケモンだけに作用し、おかしくさせているのだという。一方サトシ達とは別に行動していたジュンは鉢合わせたロケット団と共に謎の遺跡で何かをしているギンガ団を見つけ、最終的に見つかって交戦するも返り討ちにされてしまった。サトシ達もゲンと共に遺跡に辿り着いたが、ギンガ団はズイの遺跡で手に入れた槍の鍵を石碑に埋め込み、凄まじい光を発生させた。すると波導を身にまとっていたおかげで平気だったルカリオが正気を失い、サトシ達に向かって攻撃を仕掛けようとしてきた！ギンガ団の狙いとは一体何なのか...!?