史上最強のペリッパー現る!!

カナズミシティを目指して旅を続けるサトシ一行はその途中アントニーが営む施設ジムを見つけて訪れる。アントニーのペリッパーは色々なタイプの技が使える最強のポケモンと噂されていた。しかし実際はペリッパーの口の中に色々なポケモンを仕込ませていただけだった。アントニーはその秘密を知ったロケット団に脅されてペリッパーを奪われてしまう。サトシたちはアントニーが勝負に負けたトレーナーからポケモンを奪っている事を知り、アントニーのジムへ赴くが、ペリッパーを使って皆からポケモンを奪っていたのはロケット団だったと気づく。ロケット団に捕まっているところをマサトに助けられたアントニーも今までの不正を反省しサトシたちと共にロケット団を撃退する。そして、これからは正々堂々と戦い、強くなることを決意するのだった。