ピカチュウVSニャース

旅を続けるサトシ一行はロケット団の罠にまんまとはまりピカチュウを奪われてしまう。ピカチュウはニャースと特殊な線で繋がれムサシが持っている鍵が無くては外す事が出来ない。しかし突如飛来してきた野生の巨大ピジョットによってピカチュウとニャースが連れ去られてしまう。ピカチュウの電撃でピジョットから解放されるもサトシ達やロケット団とはぐれてしまったピカチュウとニャースはお互い相性が悪いながらも共に困難を乗り越えていく。ニャースもピカチュウと過ごす内にもしもピカチュウと別のところで別の形で出会っていたら友達になれたかもしれないと思い始める。しかし実際は敵同士。サトシ達やロケット団と再会すればまたいつもの関係に戻らなくてはならない。サトシはピカチュウを取り戻し、結局今回もロケット団の作戦は失敗に終わるのだった。