FBI nghi ngờ Hunter đang trả thù Jack Waltz, Bill Murphy và Hitoshi Moriyama – những người có liên quan đến quá khứ đau khổ của hắn. Tuy nhiên, Moriyama và Hunter lần lượt bị giết, khiến mọi người tin rằng kẻ bắn tỉa vẫn đang tự do. Sau đó, Murphy bị sát hại trên đường trở về Tokyo dù Conan cố gắng ngăn chặn. Sera bị thương khi cứu Conan.Conan nhận ra mục tiêu cuối cùng là Jack Waltz và phát hiện hung thủ thật sự là Kevin Yoshino, học viên cũ của Hunter. Yoshino muốn trả thù Waltz và Murphy vì cho rằng họ đã hủy hoại cuộc đời Hunter. Hắn bắn tỉa từ tháp Bell Tree nhưng bị Subaru Okiya phát hiện và tấn công từ xa.Khi Yoshino bắt Ayumi làm con tin, Conan dùng phát minh mới của tiến sĩ Agasa là giày tăng lực để đá quả bóng tạo thành pháo hoa, làm vô hiệu hóa kính hồng ngoại của hắn. Nhờ vậy, Subaru bắn rơi vũ khí của Yoshino, giúp Ran và FBI bắt giữ hắn. Cuối cùng, Subaru nghe điện thoại của James Black bằng giọng của Akai Shuichi, hé lộ bí mật về thân phận thật sự của mình.