Dianggap aneh dan ditakuti manusia, makhluk-makhluk aneh ini kemudian dikenal sebagai Mushi. Meskipun mereka tidak memiliki niat jahat terhadap manusia, banyak yang menderita akibat keberadaan dan sifat aneh mereka; mengeksploitasi Mushi tanpa memahami mereka, bahkan tanpa sengaja, dapat menyebabkan bencana dan perselisihan bagi siapa pun yang terlibat. Mushishi Zoku Shou melanjutkan kisah Mushishi Ginko dalam perjalanannya untuk membantu dunia nyata agar hidup berdampingan dengan Mushi.
Selama perjalanannya, Ginko menemukan berbagai individu berbakat—mereka yang dikutuk oleh keadaan dan mereka yang menjalin simbiosis rapuh dengan Mushi—yang mau tidak mau menghadapi pertanyaan apakah umat manusia, baik yang berbakat maupun yang tersiksa, mampu mengelola tanggung jawab atas hal-hal yang tak terlihat. Lebih lanjut, sebagai seorang Mushishi, Ginko harus mempelajari lebih lanjut tentang makhluk-makhluk aneh ini dan memutuskan apakah ia berhak untuk ikut campur dalam hubungan kompleks antara Mushi dan umat manusia.
Dianggap aneh dan ditakuti manusia, makhluk-makhluk aneh ini kemudian dikenal sebagai Mushi. Meskipun mereka tidak memiliki niat jahat terhadap manusia, banyak yang menderita akibat keberadaan dan sifat aneh mereka; mengeksploitasi Mushi tanpa memahami mereka, bahkan tanpa sengaja, dapat menyebabkan bencana dan perselisihan bagi siapa pun yang terlibat. Mushishi Zoku Shou melanjutkan kisah Mushishi Ginko dalam perjalanannya untuk membantu dunia nyata agar hidup berdampingan dengan Mushi.
Selama perjalanannya, Ginko menemukan berbagai individu berbakat—mereka yang dikutuk oleh keadaan dan mereka yang menjalin simbiosis rapuh dengan Mushi—yang mau tidak mau menghadapi pertanyaan apakah umat manusia, baik yang berbakat maupun yang tersiksa, mampu mengelola tanggung jawab atas hal-hal yang tak terlihat. Lebih lanjut, sebagai seorang Mushishi, Ginko harus mempelajari lebih lanjut tentang makhluk-makhluk aneh ini dan memutuskan apakah ia berhak untuk ikut campur dalam hubungan kompleks antara Mushi dan umat manusia.