Bumi telah kembali damai, namun diserang oleh musuh baru dengan kekuatan ruang-waktu. Musashi Haruno, pembawa acara Ultraman Cosmos, memberitahu UPG bahwa Prajurit Ultra bersama dengan Ultra-nya, Ultraman Cosmos, telah dipenjarakan di dalam benteng jahat oleh seorang prajurit wanita bernama Arena dan Etelgar, monster kuat yang telah mengalahkan enam Ultra lainnya. Nasib banyak alam semesta dipertaruhkan.