マグマ団vsアクア団、再び！えんとつ山の戦い！！

サトシ一行はフエンタウンを目指してロープウェイでえんとつ山を登っていたが、その途中制御施設がアクア団によって占拠されてロープウェイが停車してしまう。ロープウェイから脱出して助けを呼びに出たサトシはマグマ団に追われるソライシ博士と出くわす。マグマ団とアクア団の狙いはソライシ博士が見つけた隕石にあり、隕石は最終的にマグマ団の手に渡ってしまう。マグマ団はそれをエネルギーとして機械でマグマに向かって熱線を照射し、火山を活性化させようと試みていた。サトシはソライシ博士と共にマグマ団の隙を見計らって熱線の照射を止める。頑丈に閉ざされた機械から隕石を取り出すことは困難だったのでソライシ博士はどうせ奴らの手に渡るくらいならと機械を隕石が入ったままマグマに落としてマグマ団の企みを阻止した。その後サトシたちはソライシ博士と別れてデコボコ山道を下りながらフエンタウンに入るのだった。